1992 m. sausio mėn. 29 d. VTU Mokslinės tarybos sprendimu buvo įsteigtas Geodezijos institutas ir patvirtinti jo nuostatai. Geodezijos instituto veikla skirta Lietuvos valstybiniam geodeziniam pagrindui sukurti ir su jo sudarymu susijusioms mokslinėms problemoms spręsti.

Geodezijos institute dirba dauguma VGTU Geodezijos ir kadastro katedros darbuotojų, į darbus įtraukiami doktorantai, magistrantai, geodezijos specialybės studentai, gamybinių organizacijų specialistai, reikalingi konkrečiam darbui atlikti. Dalis darbų daroma drauge su užsienio šalių specialistais. Moksliniams darbams vykdyti sudaromi laikini kolektyvai, parenkant darbo vadovus, reikiamos kvalifikacijos vykdytojus bei konsultantus.

2000 m. sausio 31 d. institute įsteigta Kalibravimo laboratorija. Akreditacijos sritis – elektroninių tolimačių kalibravimas. Vedėjas – doc. dr. R. Putrimas.

Siūlomos paslaugos: Geodezinio pagrindo sudarymo technologijų tyrimai, Žemės sunkio ir geomagnetinio laukų tyrimai, geodinaminių procesų tyrimai, geodezinių aukščių nustatymas, gravimetriniai ir magnetometriniai matavimai, nekilnojamųjų daiktų kadastro ekspertizė, geodezinių prietaisų (teodolitų, tacheometrų ir t.t.) kalibravimas, preciziniai kampų matavimai.